Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRCDQ00LT1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms