Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms