Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoa1Q00623 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoa1Q00623 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms