Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2bP67871 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms