Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms