Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCA2P51587 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms