Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms