Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms