Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms