Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFTRP13569 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFTRP13569 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFTRP13569 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFTRP13569 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFTRP13569 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFTRP13569 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CFTRP13569 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFTRP13569 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms