Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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