Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L13C9JLJ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms