Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DSR2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DSR2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DSR2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DSR2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DSR2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DSR2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms