Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms