Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDKN3Q16667 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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