Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms