Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USF2Q15853 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USF2Q15853 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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