Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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