Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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