Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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