Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LMAN2Q12907 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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