Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ACADSBP45954 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ACADSBP45954 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms