Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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