Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GOPCQ9HD26 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms