Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL359979.1-201ENST00000446145 487 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ANKRD39Q53RE8 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL133372.2-202ENST00000549360 768 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CD160-204ENST00000584442 219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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ANKRD39Q53RE8 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ANKRD39Q53RE8 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ANKRD39Q53RE8 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ANKRD39Q53RE8 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Z74696.1-201ENST00000428208 1123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP50-201ENST00000452821 795 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC017104.1-203ENST00000454416 466 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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