Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FAM187BQ17R55 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms