Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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