Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms