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| BRD3 | Q15059 | MYNN-203 | ENST00000544106 | 4815 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AMY1C-201 | ENST00000370079 | 1632 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | IFNG-201 | ENST00000229135 | 1218 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | FNBP1L-206 | ENST00000604705 | 1830 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.39 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC025125.1-201 | ENST00000624743 | 1922 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM216B-201 | ENST00000313851 | 3243 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | ELF2-203 | ENST00000379550 | 3278 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090229.1-201 | ENST00000590983 | 1609 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | B3GNT5-201 | ENST00000326505 | 4123 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | FANCI-201 | ENST00000300027 | 4713 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | DOCK7-211 | ENST00000634264 | 6303 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GSTA1-201 | ENST00000334575 | 1019 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL512422.1-201 | ENST00000407033 | 553 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | FCF1P2-201 | ENST00000415284 | 583 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | DNAJA1P1-201 | ENST00000425106 | 1187 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC009158.1-207 | ENST00000432973 | 394 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL138799.2-201 | ENST00000439024 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | EIF4A1P6-201 | ENST00000448133 | 1210 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC017067.1-201 | ENST00000448570 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068492.1-201 | ENST00000448672 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF886P-201 | ENST00000450781 | 723 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | KCNMB2-AS1-205 | ENST00000451742 | 844 nt | TSL 4 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | BX546450.1-201 | ENST00000454307 | 482 nt | TSL 2 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092155.2-201 | ENST00000454675 | 477 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP006216.2-201 | ENST00000457746 | 333 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | SSBP1-211 | ENST00000484178 | 676 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC020651.1-201 | ENST00000490324 | 360 nt | TSL 3 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB109F-201 | ENST00000491870 | 277 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC134050.1-201 | ENST00000495088 | 933 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC113347.3-201 | ENST00000509113 | 148 nt | BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC015771.1-201 | ENST00000527283 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | PIH1D2-206 | ENST00000528775 | 1025 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP005436.3-201 | ENST00000532849 | 572 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL031600.2-201 | ENST00000563223 | 307 nt | TSL 5 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC127502.1-204 | ENST00000564861 | 618 nt | TSL 3 BASIC | 5.38 | □□□□□ -1.55 | | |