Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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