Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms