Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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