Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
DUSP4Q13115 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms