Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTP4A2Q12974 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms