Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CTDSPL2Q05D32 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CTDSPL2Q05D32 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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CTDSPL2Q05D32 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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CTDSPL2Q05D32 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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CTDSPL2Q05D32 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CTDSPL2Q05D32 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CTDSPL2Q05D32 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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