Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms