Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MCCD1P59942 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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