Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms