Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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