Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PTPRCP08575 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPRCP08575 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PTPRCP08575 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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