Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP35Q9P2H5 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP35Q9P2H5 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP35Q9P2H5 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP35Q9P2H5 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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USP35Q9P2H5 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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