Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP13-3Q3SY46 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms