Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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