Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL4BQ13620 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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