Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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