Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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