Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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