Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SRSF5Q13243 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms