Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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GRIK2Q13002 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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GRIK2Q13002 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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