Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms