Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL357055.3-201ENST00000421157 2459 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC090241.3-201ENST00000621730 2599 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MPI-213ENST00000566377 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL080317.1-201ENST00000444259 557 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC096708.1-201ENST00000584419 658 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC027139.2-201ENST00000615639 448 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CCT5P1-201ENST00000502314 1618 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms